Il Museo Archeologico Civico, inaugurato nel 1985 all'interno di un convento francescano risalente al XVI secolo, ha trovato una nuova sede nel 2003 nell’ex convento settecentesco delle Recoletas de Santa Clara, che è stato appositamente restaurato e ristrutturato. Questo convento, originariamente istituito nel 1753 per ospitare le Clarisse di Tempio, è stato invece utilizzato dalle monache di Orosei a causa delle loro difficoltà economiche. Nel 1889, a causa della legge Ratazzi, l'edificio fu requisito per ospitare i militari, che vi stabilirono la caserma Pietro Micca. Nel 1953, i militari abbandonarono l'edificio e l'anno successivo una parte fu donata alla chiesa, mentre l'altra parte rimase di proprietà comunale e fu utilizzata per scopi scolastici, sociali e residenziali.
Grazie a finanziamenti regionali ed europei per il recupero di edifici monumentali, l'edificio fu restaurato e completato nel 2002, diventando così la nuova sede del Museo Archeologico Civico di Ozieri, noto come "Alle Clarisse". L'ingresso originale del museo si trovava in via Azuni e dava accesso a tre ambienti voltati collegati da un ampio corridoio anch'esso voltato.
I militari modificarono l'ingresso spostandolo esattamente sul lato opposto e rinforzarono le antiche mura spagnole trasformandole nei bastioni attuali. Costruirono anche un terrapieno che divenne la piazza d'armi e una scalinata in granito che divenne l'ingresso principale della struttura. Aggiunsero anche un piano superiore su una parte dell'edificio, distinguendolo dall'altra parte per il tetto a capriata di legno in stile piemontese.
Nel cortile esterno è stato allestito un piccolo lapidario che ospita una stele centinata di una tomba dei giganti, bacili nuragici e l'architrave della chiesa campestre di San Luca.
Al primo piano, la Sala I è dedicata alla preistoria, con reperti che vanno dal Neolitico Medio al Neolitico Recente Sardo. La Sala II è dedicata alla civiltà nuragica, mentre la Sala III esplora l'età fenicio-punica e romana. La Sala IV presenta reperti medievali, tra cui oggetti in metallo, ceramiche e manufatti in osso e avorio. Al secondo piano, la sezione numismatica espone una vasta collezione di monete che spaziano dalle monete greche e puniche fino alle monete dell'epoca sabauda. La sezione etnografica presenta una varietà di oggetti donati da privati, tra cui ritratti, abiti tradizionali e materiali musicali.