Il Museo del Cavallo trova la sua sede nel Palazzo Borgia. Una parte di questo antico edificio, che in passato ospitava la chiesa di Sant’Isidoro e successivamente fu trasformata in scuderia, oggi accoglie la preziosa raccolta museale dell'Istituto Incremento Ippico. Il Museo si articola in due sezioni distintive: una sezione storica, arricchita da documenti, stemmi e lastre fotografiche raffiguranti gli stalloni, e una collezione artistica che comprende manifesti, dipinti e statue dedicate al cavallo. Tra queste opere spicca il celebre centauro di Francesco Ciusa, simbolo dell'interconnessione tra uomo e animale che caratterizza il rapporto millenario con il cavallo.
La formazione della raccolta museale è stata il frutto di un meticoloso processo di ricerca, recupero e restauro dei reperti, svoltosi nell'ambito del sottoprogramma culturale del progetto “La risorsa equina nelle politiche di diversificazione dell'attività agricola”. Questo approccio ha trovato le sue radici all'interno dell'Istituto Incremento Ippico, dove, attraverso un'analisi accurata degli archivi cartacei e fotografici e una minuziosa consultazione degli inventari, è stato ricostruito il quadro storico relativo al patrimonio di beni documentali, artistici e culturali legati all'uomo e al cavallo in Sardegna.
Il processo di ricerca si è successivamente esteso agli archivi di Stato, comunali e provinciali, che in qualche modo erano collegati all'attività dell'ente e al suo contesto operativo. L'obiettivo era quello di garantire una solida base storica nella ricostruzione del quadro di riferimento e di colmare eventuali lacune documentarie, risultato delle molteplici gestioni che si sono susseguite nel corso del tempo.